根据中共中央、国务院批准的北京市人民政府机构改革方案和《北京市人民政府关于机构设置的通知》（京政发〔2009〕2号，设立北京市知识产权局。北京市知识产权局是负责北京市知识产权保护组织协调工作和专利工作的市政府直属机构。

北京市商务局是根据中共中央、国务院批准的《北京市人民政府机构改革方案》和《北京市人民政府关于机构设置的通知》（京政发200318号）而组建的政府机构。

北京市生态环境局市北京市机构改革中新组建的部门：将市环境保护局的职责，以及市发展和改革委员会的应对气候变化和减排职责，市规划和国土资源管理委员会的监督防止地下水污染职责，市水务局的编制水功能区划、排污口设置管理、流域水环境保护职责，市农业局的监督指导农业面源污染治理职责，市南水北调工程建设委员会办公室的南水北调工程项目区环境保护职责等整合，组建市生态环境局，作为市政府组成部门。

2018年11月，北京市粮食和物资储备局成立。

北京市人民防空办公室（简称市人防办）是市政府直属机构，为正局级。

根据中共中央、国务院批准的北京市人民政府机构改革方案和《北京市人民政府关于机构设置的通知》（京政发〔2009〕2号），设立北京市司法局（简称市司法局）。北京市司法局是负责本市司法行政工作的市政府组成部门。市司法局设14个内设机构和政治部，机关政法专项编制234名。