新疆维吾尔自治区人民政府是新疆维吾尔自治区人民代表大会的执行机关，是新疆维吾尔自治区的国家行政机关，驻地位于中华人民共和国新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市中山路479号，对新疆维吾尔自治区人民代表大会和中华人民共和国国务院负责并报告工作。

伊犁哈萨克自治州人民政府是伊犁哈萨克自治州的地方国家行政机关，是伊犁哈萨克自治州人民代表大会的执行机关，对伊犁哈萨克自治州人民代表大会及其常务委员会和新疆维吾尔自治区人民政府负责并报告工作，每届任期五年，实行州长负责制。

新疆维吾尔自治区通信管理局于2001年1月5日正式成立，实行由工业和信息化部与自治区人民政府双重领导、以工业和信息化部为主的管理体制，是在电信法律法规和工业和信息化部、自治区人民政府授权范围内，对新疆电信业实施监督管理的政府职能部门。

新疆维吾尔自治区交通运输厅是自治区人民政府主管交通运输的政府职能部门，厅机关目前内设16个处室（改革后）和8个未设党委的事业单位，下辖自治区交通建设管理局、公路管理局、道路运输管理局、路政管理局、地方海事局、交通运输工程质量监督局、公路工程造价管理局7个职能局，交通职业技术学院1个事业单位和新疆交通投资有限责任公司1个企业，主要承担全区国省干线、国边防、农村和专用公路的建、管、养、运，公路、水运的发展规划、市场监管，以及国际道路运输管理等12个方面的职能职责，所属副厅级单位3个、县（处）级单位101个、科级单位238个，行业指导15个地州市和98个县市区交通运输局。

中华人民共和国乌鲁木齐海关是国务院批准的正局级海关，是全国监管面积最大的中华人民共和国海关总署直属海关。

喀什地区行政公署