根据《中共江西省委、江西省人民政府关于印发〈江西省人民政府机构改革实施方案〉的通知》（赣发〔2009〕5号），保留江西省水利厅，为省人民政府组成部门。

江西省科技厅负责组织制订实施全省各类科技计划和重大科技专项与工程，负责统筹协调基础研究、应用技术研究和社会公益性技术研究以及国民经济与社会发展重大关键技术攻关。

江西省商务厅是负责贯彻执行国家和省有关国内外贸易、外商投资、对外投资与经济合作的法律、法规、规章和方针政策的政府机关。

江西省自然资源厅，是江西省机构改革新组建的单位。

江西省人民政府台湾事务办公室（简称：江西省台办），是江西省人民政府主管全省台湾工作的办事机构。内设秘书处（人事处）、宣传（新闻）处、经济处、联络处、调研处投诉协调处、省台湾同胞接待站。

根据《中共江西省委 江西省人民政府关于印发〈江西省人民政府机构改革实施方案〉的通知》（赣发〔2009〕5号），江西省监狱管理局为江西省司法厅管理的副厅级行政机构。