昌都市人民政府是昌都市的国家行政机关，是昌都市人民代表大会的执行机关，对昌都市人民代表大会和西藏自治区人民政府负责并汇报工作。

中华人民共和国拉萨海关是国家设立在西藏自治区的进出境监督管理机关，总关位于西藏自治区首府拉萨市，海关实行集中统一的垂直领导体制，拉萨海关由中华人民共和国海关总署直接领导。

西藏自治区粮食和物资储备局，是西藏自治区机构改革设立的新部门。

西藏自治区司法厅是主管全区司法行政工作的自治区人民政府的组成部门。

2009年，西藏自治区政府机构改革后，在原西藏自治区人事厅和原西藏自治区劳动保障厅的基础上新组建了西藏自治区人力资源和社会保障厅，为西藏自治区人民政府组成部门。

西藏自治区民政厅是是西藏自治区人民政府工作部门。