青海省水利厅负责保障水资源的合理开发利用，拟定水利发展规划和政策，起草有关法规规章草案，组织拟定省管主要河湖的流域综合规划、防洪规划等重大水利规划。

青海省供销合作社联合社是全省供销合作社的联合组织，由省政府领导，与原省贸易厅合署办公。1999年底，在省级行政机构改革中，省供销社机构单设，独立运作。

青海省工商业联合会，又称青海省商会，成立于1954年10月，省工商联是中国共产党领导的省工商界组成的人民团体和商会组织。

青海省林业和草原局，隶属于青海省人民政府，是2018年青海省机构改革新组建的单位。

青海省机构编制委员会办公室是青海省机构编制委员会常设办事机构，承担省委、省政府交办的其他事项。

中华人民共和国西宁海关是受海关总署直接领导，负责指定口岸及相关区域范围内海关工作运行管理、监督监控的正厅级直属海关。领导曹家堡机场海关、西海海关、格尔木海关。西宁海关管辖范围为青海省的各项海关管理工作。