新疆维吾尔自治区生态环境厅，是新疆维吾尔自治区机构改革设置的新部门。

新疆维吾尔自治区农牧业机械管理局是新疆维吾尔自治区人民政府主管全区农牧业机械管理工作的职能部门。

新疆维吾尔自治区统计局是新疆维吾尔自治区人民政府政府直属机构。

新疆维吾尔自治区交通运输厅是自治区人民政府主管交通运输的政府职能部门，厅机关目前内设16个处室（改革后）和8个未设党委的事业单位，下辖自治区交通建设管理局、公路管理局、道路运输管理局、路政管理局、地方海事局、交通运输工程质量监督局、公路工程造价管理局7个职能局，交通职业技术学院1个事业单位和新疆交通投资有限责任公司1个企业，主要承担全区国省干线、国边防、农村和专用公路的建、管、养、运，公路、水运的发展规划、市场监管，以及国际道路运输管理等12个方面的职能职责，所属副厅级单位3个、县（处）级单位101个、科级单位238个，行业指导15个地州市和98个县市区交通运输局。

根据中共中央办公厅、国务院办公厅《关于印发新疆维吾尔自治区人民政府机构改革方案的通知》（厅字〔2009〕7号），设立新疆维吾尔自治区司法厅（以下简称自治区司法厅），为自治区人民政府组成部门。

新疆维吾尔自治区供销合作社联合社始建于1950年，是集农副产品生产、加工、购销，农业生产资料和日用消费品供应、进出口贸易、房地产开发、仓储物流、交易市场、宾馆旅游、餐饮服务等为一体，经营网络遍布全区城乡和内地大中城市的大型经济联合体。