福建省商务厅（加挂“福建省人民政府口岸工作办公室”牌子），为福建省人民政府组成部门，正厅级。

福建省自然资源厅是省政府组成部门，为正厅级。

福建省退役军人事务厅，将福建省民政厅的退役军人优抚安置和拥军优属职责，福建省人力资源和社会保障厅的军官转业安置职责，以及军队等相关职责整合，组建省退役军人事务厅，作为省政府组成部门，正厅级。

福建省疾病预防控制中心成立于2003年7月，由福建省卫生防疫站、福建省结核病防治所、福建省健康教育所和福建省皮肤病防治院中性病麻风病社会防治科室合并组建而成福建省疾病预防控制中心，同时增挂福建省健康教育促进中心和福建省卫生检验中心两面牌子。

福建省经济信息中心为省发展和改革委员会管理的事业单位,机构规格相当副厅级。

2018年6月15日，根据《中共中央关于深化党和国家机构改革的决定》《国务院机构改革方案》和国家税务总局关于国税地税征管体制改革的部署要求，福建省国家税务局、地方税务局正式合并成立国家税务总局福建省税务局。