国家税务总局上海市税务局是上海市人民政府机构。

上海市医疗保障局是上海市人民政府机构。

上海市人民检察院是本市的法律监督机关。领导本市各级人民检察院依法履行法律监督职能，接受最高人民检察院领导，对上海市人民代表大会及其常务委员会负责并报告工作。

中华人民共和国上海出入境边防检查总站，简称“上海边检总站”，隶属公安部垂直领导，正厅级建制单位，人民警察编制。

中华人民共和国上海海事局（简称“上海海事局”）成立于1999年6月18日，为交通运输部直属正厅级行政机构，对所辖海区和港口水域的交通安全实行统一监督管理。负责辖区内水上安全、防止船舶污染、船舶和海上设施检验、港口航道测绘管理等工作。

上海市民族和宗教事务局是主管全市民族和宗教事务的市政府组成部门，归口中共上海市委统一战线工作部领导，为正局级。