重庆市万州区人民政府是重庆市万州区人民代表大会的执行机关，是重庆市万州区的一级国家行政机关；对万州区人民代表大会和重庆市人民政府负责；在万州区人民代表大会闭幕期间，对万州区人民代表大会常务委员会负责并报告工作。