2018年10月，为贯彻落实中办、国办印发的《福建省机构改革方案》（以下简称《方案》），福建省委办公厅、省政府办公厅印发《福建省省级机构改革实施方案》（以下简称《实施方案》），推动各项改革任务落地见效，福建省知识产权局组建成立。

福建省海洋与渔业局是根据《福建省机构改革方案》（以下简称《方案》），福建省委办公厅、省政府办公厅印发《福建省省级机构改革实施方案》（以下简称《实施方案》）组建。