2005年6月，为实现对长白山的“统一规划、统一保护、统一开发、统一管理”，中国共产党吉林省委员会、吉林省人民政府决定成立长白山管委会。

松原市人民政府是松原市的行政管理机关。政府办公地址为中国吉林省松原市沿江东路339号。

延边朝鲜族自治州，首府驻延吉市，是吉林省的9个地级行政区之一。

白城市人民政府是白城市的行政管理机关。

白山市人民政府是白山市的行政管理机关。政府办公地址：白山市通江路。

通化市人民政府是通化市的行政管理机关。政府办公地址：中国吉林省通化市新华大街499号。

辽源市人民政府是辽源市的行政管理机关。政府办公地址：辽源市人民大街217号。

四平市人民政府是四平市的行政管理机关。政府办公地址：中国吉林省四平市市府路59号。

吉林市人民政府是由吉林省人民政府直接领导的地市级权力机构的执行部门，对市人大及其常务委员会，同时对省政府负责并报告工作。

长春市人民政府是长春市的行政管理机关，是中华人民共和国吉林省人民政府管辖的副省级地方行政机关，对长春市人大及其常务委员会，同时对吉林省人民政府负责并报告工作。

吉林省退役军人事务厅是吉林省人民政府的组成部门（正厅级）。

吉林省医疗保障局是吉林省机构改革后组建的新部门，属吉林省人民政府直属机构。

吉林省信访局，根据《中共中央办公厅国务院办公厅关于印发<吉林省人民政府机构改革方案>的通知》（厅字[2003]44号），中共吉林省委、吉林省人民政府信访局列入省委工作部门序列，业务上接受省委办公厅、省政府办公厅的指导。

吉林省政务服务和数字化建设管理局是吉林省人民政府的直属机构，组建于2018年10月。

吉林省供销社始建于1949年，坐落于吉林省省会长春市。

吉林省能源局(副厅级)，成立于2008年，为省发展和改革委员会管理的部门管理机构。

吉林省地震局实行中国地震局和吉林省人民政府双重领导，以中国地震局为主的管理体制。根据授权承担本行政区域内防震减灾工作政府行政管理职能，依法履行防震减灾主管机构的各项职责。

吉林省地质矿产勘查开发局（简称吉林省地矿局）建局于1958年,为省政府直属正厅级事业单位。

吉林省地方志编纂委员会是吉林省人民政府直属的依公管理的具有行政职能的一级事业单位。坚持“党委领导、政府主持”的修志体制，负责组织吉林省的地方志工作。

吉林省邮政管理局于2006年9月12日正式成立，是经国务院批准设立的副厅级邮政监管机构，负责全省邮政行业管理工作，履行政府监管职能，受国家邮政局垂直领导，且实行党组制，党的关系在地方。

吉林省促进中小企业发展服务中心是吉林省工信厅直属单位，主要职责：贯彻落实国家和省有关中小企业的法律法规和方针政策；为中小企业及民营企业提供创业、融资、技术、信息、咨询和维权等综合服务；建设全省中小企业社会化服务体系等。

根据《中共中央办公厅、国务院办公厅关于印发〈吉林省人民政府机构改革方案〉的通知》（厅字〔2008〕25号）,组建吉林省公务员局（副厅级）,为省人力资源和社会保障厅管理的部门管理机构。

吉林省妇女联合会是吉林省各族各界妇女在省委领导下为争取进一步解放而联合起来的社会群众团体，是党和政府联系妇女群众的桥梁和纽带。

吉林省通信管理局于2001年3月6日正式挂牌成立。

吉林省农业科学院（Jilin Academy of Agricultural Sciences）又名中国农业科技东北创新中心，是吉林省政府直属的以应用研究为主，兼顾应用基础研究和公益性科技工作的综合性农业科研机构。

中国国际贸易促进委员会吉林省委员会（中国国际商会吉林商会）是由吉林省经济贸易界有代表性的人士、企业、协会和团体组成的全省民间对外经济贸易组织。

吉林省残疾人联合会成立于1989年。吉林省残疾人联合会为归口省政府管理，参照《国家公务员法》管理独立开展工作、计划单列的正厅级单位。

长春海关，是国家派驻吉林省的进出（关）境监督管理机关，依法担负对进出吉林省各口岸的交通工具、货物、行李物品、邮递物品的查验、征税、缉私和海关统计等项任务。

吉林省扶贫开发办公室是根据《吉林省机构改革方案》，我省组建吉林省扶贫开发办公室，作为吉林省政府直属机构。

吉林省高速公路管理局于1997年2月经省机构编制委员会正式批准成立（副厅级建制），主要负责全省高速公路的养护（高速公路日常养护、受损路产维修、筑路机械设备管理、高速公路绿化、标志标线）、收费（高速公路通行费收取、收费员管理、收费情况监控、收费稽查）、路政（路政执法、维护路产路权、处理高速公路交通事故及路产赔偿案件、办理占用高速公路用地手续、事故车和故障车拖拽、清障）、通信（数据通信、光纤传输、机电设备维修维护、紧急电话的线路维护）、经营（服务区经营管理、经营投资）等管理工作。